地中海饮食(5 年 · 三臂)
GSE107205 · 饮食 · 甲基化 450K · 复现臂
设计 个体配对 基线→5 年(三臂×12)n 36 对PMID 29295516角色 复现臂(发现集:GSE58280)
读法:发现-复现设计中的复现臂:饮食 5 年后基因层存在全局低幅高甲基化漂移(中位 +0.015,负向 36.3%——闸1 如实披露),但模块/通路层经三闸 FWER 校准后净检出为 0。
replicated-null · No module-level response detected (FWER-controlled)
主图 · 模块命中瀑布 · 无 FWER 显著命中(null-state;阈值 5.4e-07 级,n=36)
副图 · 全库注释深度 · 四库注释深度——全库 7,296 集合仅 1 项贴线(KEGG 病毒信号条目HIV gp120→CXCR4,与本干预语境无关,属期望假阳性形态)
三闸质控(全局漂移 → 随机集对照 → 置换 FWER)
| 闸1 · 全局漂移 | 读数中位 | 负向占比 |
|---|
| 基因均值轨 | +0.0147 | 36.3% |
| 引擎读数轨 | +0.0847 | 31.9% |
| 字典 | 可评集合 | FWER 净检出 | 闸3 阈值(置换 B=400) | 闸2 随机门底噪 |
|---|
| 332 模块字典 | 332 | 0 | 2.43e-06 | 20% |
| GOBP | 2430 | 0 | 5.40e-07 | 0% |
| REACTOME | 516 | 0 | 2.44e-06 | 15% |
| KEGG | 183 | 0 | 2.44e-06 | 25% |
| HALLMARK | 50 | 0 | 6.49e-06 | 15% |
检出器:集合级配对检验 × 多尺度响应表征引擎读数;族错误率由 sign-flip 置换校准(B=400,minP 5% 分位)。阈值与底噪逐字典在档,可复跑。
这一结果意味着什么
在本口径下(集合级配对检验 + 置换族错误率控制,B=400),地中海饮食 5 年未产生显著的模块/通路级甲基化响应。这是检测结果,不是"饮食无效":原文报告的位点级变化(CPT1B/GNAS)属另一检测层,与模块层阴性并行不悖。敢报阴性,是这套证据体系可信的来源。
数字由确定性管线程序化生成本页(可复跑,种子固定);检测方法不构成疗效声明;客户数据代号化处理。
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