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葡萄籽黄烷醇 MOF(8 周)

GSE54643 · 营养补充 · 甲基化 450K · 独立验证
设计 个体配对 补充前→8 周n 10 对(男性吸烟者)口径 三闸 FWER(置换 B=400)
读法:小样本营养干预:闸1 存在低幅全局低甲基化漂移(中位 −0.018,负向 75.8%——如实披露);模块层 21 项过闸,但命中计数落在该阈值随机期望带内(GOBP 11 vs 期望 12.3)。
verified-null · hit counts within null expectation (FWER-controlled)
21 项过闸命中(n=10 阈值离散地板 5.1e-03,功效受限)
主图 · 模块命中瀑布 · 21 项过闸命中(n=10 阈值离散地板 5.1e-03,功效受限)
四库注释深度——命中计数处于零期望带
副图 · 全库注释深度 · 四库注释深度——命中计数处于零期望带

三闸质控(全局漂移 → 随机集对照 → 置换 FWER)

闸1 · 全局漂移读数中位负向占比
基因均值轨-0.017875.8%
引擎读数轨-0.061269.7%
字典可评集合FWER 净检出闸3 阈值(置换 B=400)闸2 随机门底噪
332 模块字典33205.06e-0315%
GOBP2430115.06e-030%
REACTOME51695.06e-030%
KEGG18315.06e-030%
HALLMARK5005.06e-0320%
检出器:集合级配对检验 × 多尺度响应表征引擎读数;族错误率由 sign-flip 置换校准(B=400,minP 5% 分位)。阈值与底噪逐字典在档,可复跑。

GOBP · 命中明细(11 项)

集合方向(引擎读数)p
GOBP_NEGATIVE_REGULATION_OF_PROTEIN_SERINE_THREONINE_KINASE_ACTIVITY上调(+0.0435)5.06e-03
GOBP_REGULATION_OF_NEURON_MIGRATION下调(-0.0310)5.06e-03
GOBP_REGULATION_OF_LIPID_STORAGE下调(-0.0280)5.06e-03
GOBP_IRON_ION_TRANSPORT下调(-0.0226)5.06e-03
GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_STEROID_BIOSYNTHETIC_PROCESS下调(-0.0226)5.06e-03
GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_PATTERN_RECOGNITION_RECEPTOR_SIGNALING_PATHWAY上调(+0.0213)5.06e-03
GOBP_TRANSMISSION_OF_NERVE_IMPULSE下调(-0.0211)5.06e-03
GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_TYPE_II_INTERFERON_PRODUCTION上调(+0.0199)5.06e-03
GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_PROTEIN_LOCALIZATION_TO_MEMBRANE下调(-0.0190)5.06e-03
GOBP_RECEPTOR_CLUSTERING下调(-0.0169)5.06e-03
GOBP_KETONE_METABOLIC_PROCESS上调(+0.0082)5.06e-03

REACTOME · 命中明细(9 项)

集合方向(引擎读数)p
REACTOME_DEPOSITION_OF_NEW_CENPA_CONTAINING_NUCLEOSOMES_AT_THE_CENTROMERE上调(+0.0528)5.06e-03
REACTOME_AMYLOID_FIBER_FORMATION上调(+0.0414)5.06e-03
REACTOME_SIALIC_ACID_METABOLISM下调(-0.0345)5.06e-03
REACTOME_COLLAGEN_CHAIN_TRIMERIZATION下调(-0.0258)5.06e-03
REACTOME_ECM_PROTEOGLYCANS下调(-0.0251)5.06e-03
REACTOME_MAP2K_AND_MAPK_ACTIVATION上调(+0.0250)5.06e-03
REACTOME_COLLAGEN_BIOSYNTHESIS_AND_MODIFYING_ENZYMES下调(-0.0232)5.06e-03
REACTOME_COLLAGEN_FORMATION下调(-0.0156)5.06e-03
REACTOME_INTERLEUKIN_1_FAMILY_SIGNALING上调(+0.0143)5.06e-03

KEGG · 命中明细(1 项)

集合方向(引擎读数)p
KEGG_MEDICUS_REFERENCE_FGF_FGFR_PI3K_SIGNALING_PATHWAY下调(-0.0320)5.06e-03

这一结果意味着什么

n=10 下 W 检验的离散地板使阈值放宽至 5.1e-03、功效受限;21 项命中中 GOBP/KEGG/HALLMARK/332 计数均在该阈值的随机期望带内(REACTOME 9 vs 期望 2.6 为弱超出,不作发现)。定性:模块层≈零假设——如实披露,不装饰为发现。
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