葡萄籽黄烷醇 MOF(8 周)
GSE54643 · 营养补充 · 甲基化 450K · 独立验证
设计 个体配对 补充前→8 周n 10 对(男性吸烟者)口径 三闸 FWER(置换 B=400)
读法:小样本营养干预:闸1 存在低幅全局低甲基化漂移(中位 −0.018,负向 75.8%——如实披露);模块层 21 项过闸,但命中计数落在该阈值随机期望带内(GOBP 11 vs 期望 12.3)。
verified-null · hit counts within null expectation (FWER-controlled)
主图 · 模块命中瀑布 · 21 项过闸命中(n=10 阈值离散地板 5.1e-03,功效受限)
副图 · 全库注释深度 · 四库注释深度——命中计数处于零期望带
三闸质控(全局漂移 → 随机集对照 → 置换 FWER)
| 闸1 · 全局漂移 | 读数中位 | 负向占比 |
|---|
| 基因均值轨 | -0.0178 | 75.8% |
| 引擎读数轨 | -0.0612 | 69.7% |
| 字典 | 可评集合 | FWER 净检出 | 闸3 阈值(置换 B=400) | 闸2 随机门底噪 |
|---|
| 332 模块字典 | 332 | 0 | 5.06e-03 | 15% |
| GOBP | 2430 | 11 | 5.06e-03 | 0% |
| REACTOME | 516 | 9 | 5.06e-03 | 0% |
| KEGG | 183 | 1 | 5.06e-03 | 0% |
| HALLMARK | 50 | 0 | 5.06e-03 | 20% |
检出器:集合级配对检验 × 多尺度响应表征引擎读数;族错误率由 sign-flip 置换校准(B=400,minP 5% 分位)。阈值与底噪逐字典在档,可复跑。
GOBP · 命中明细(11 项)
| 集合 | 方向(引擎读数) | p |
| GOBP_NEGATIVE_REGULATION_OF_PROTEIN_SERINE_THREONINE_KINASE_ACTIVITY | 上调(+0.0435) | 5.06e-03 |
| GOBP_REGULATION_OF_NEURON_MIGRATION | 下调(-0.0310) | 5.06e-03 |
| GOBP_REGULATION_OF_LIPID_STORAGE | 下调(-0.0280) | 5.06e-03 |
| GOBP_IRON_ION_TRANSPORT | 下调(-0.0226) | 5.06e-03 |
| GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_STEROID_BIOSYNTHETIC_PROCESS | 下调(-0.0226) | 5.06e-03 |
| GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_PATTERN_RECOGNITION_RECEPTOR_SIGNALING_PATHWAY | 上调(+0.0213) | 5.06e-03 |
| GOBP_TRANSMISSION_OF_NERVE_IMPULSE | 下调(-0.0211) | 5.06e-03 |
| GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_TYPE_II_INTERFERON_PRODUCTION | 上调(+0.0199) | 5.06e-03 |
| GOBP_POSITIVE_REGULATION_OF_PROTEIN_LOCALIZATION_TO_MEMBRANE | 下调(-0.0190) | 5.06e-03 |
| GOBP_RECEPTOR_CLUSTERING | 下调(-0.0169) | 5.06e-03 |
| GOBP_KETONE_METABOLIC_PROCESS | 上调(+0.0082) | 5.06e-03 |
REACTOME · 命中明细(9 项)
| 集合 | 方向(引擎读数) | p |
| REACTOME_DEPOSITION_OF_NEW_CENPA_CONTAINING_NUCLEOSOMES_AT_THE_CENTROMERE | 上调(+0.0528) | 5.06e-03 |
| REACTOME_AMYLOID_FIBER_FORMATION | 上调(+0.0414) | 5.06e-03 |
| REACTOME_SIALIC_ACID_METABOLISM | 下调(-0.0345) | 5.06e-03 |
| REACTOME_COLLAGEN_CHAIN_TRIMERIZATION | 下调(-0.0258) | 5.06e-03 |
| REACTOME_ECM_PROTEOGLYCANS | 下调(-0.0251) | 5.06e-03 |
| REACTOME_MAP2K_AND_MAPK_ACTIVATION | 上调(+0.0250) | 5.06e-03 |
| REACTOME_COLLAGEN_BIOSYNTHESIS_AND_MODIFYING_ENZYMES | 下调(-0.0232) | 5.06e-03 |
| REACTOME_COLLAGEN_FORMATION | 下调(-0.0156) | 5.06e-03 |
| REACTOME_INTERLEUKIN_1_FAMILY_SIGNALING | 上调(+0.0143) | 5.06e-03 |
KEGG · 命中明细(1 项)
| 集合 | 方向(引擎读数) | p |
| KEGG_MEDICUS_REFERENCE_FGF_FGFR_PI3K_SIGNALING_PATHWAY | 下调(-0.0320) | 5.06e-03 |
这一结果意味着什么
n=10 下 W 检验的离散地板使阈值放宽至 5.1e-03、功效受限;21 项命中中 GOBP/KEGG/HALLMARK/332 计数均在该阈值的随机期望带内(REACTOME 9 vs 期望 2.6 为弱超出,不作发现)。定性:模块层≈零假设——如实披露,不装饰为发现。
数字由确定性管线程序化生成本页(可复跑,种子固定);检测方法不构成疗效声明;客户数据代号化处理。
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